ウェットレースとなったマレーシアＧＰ。序盤はヤマハのホルヘ・ロレンソ（手前）とホンだのダニ・ペドロサ（後方）が安定した走りで、３位以下を引き離す
ウェットレースの第１６戦マレーシアＧＰ。悪天候のセパン・インターナショナル・サーキットは激しい雨のために転倒者が続出する、波乱のレースとなった。
ホルヘ・ロレンソ（ヤマハ）が年間チャンピオン獲得を賭けて臨んだ第１６戦は、あいにくの天候となり、各チームはレース前から困難な対応を強いられていた。ホーム、バックと２本のストレートが特徴的なこのサーキットは前日、ロレンソが新しいコースレコードを叩き出し、決勝での走りに期待が高まっていただけに、何とか回復を願っていたが、それは叶わないままスタートを迎えた。
スタート前に「ウェットレース」宣言され、波乱が予想されたが、ポール・ポジションのロレンソ、２番手のダニ・ペドロサ（ホンダ）は綺麗にスタートを決め、ロレンソがホールショットを奪う。予選３番手のアンドレア・ドビツィオーゾ（モンスターヤマハテック３）はスタートに失敗して順位を落とし、雨のフランスＧＰでも強さを見せたバレンティーノ・ロッシ（ドゥカティ）が１１番手から５位まで一気に浮上した。
レース序盤はここ数戦見慣れた展開で進んで行く。２分１５秒台で周回するのはトップ２のみで、徐々に３位のケーシー・ストーナー（ホンダ）以下を引き離していく。
レースが動いたのは９周目。バックストレートエンドでペドロサがトップに立つと、そこから少しずつロレンソとの差を広げていく。
しかし、強くなる雨足がレース続行を許さなかった。転倒者も続出し、危険と判断されたレースは１４周目に赤旗が提示され、１３周目のポジションで順位が確定した。
優勝はペドロサ。これで自信初の３連勝となり、２位に入ったロレンソとの差を２３ポイント差とし、チャンピオンシップに望みを繋いだ。３位には復帰後初の表彰台となるストーナー、４位には今シーズンベストリザルトとなるニッキー・ヘイデン（ドゥカティ）が入り、同僚のロッシも５位と続いた。ヤマハ勢はドビツィオーゾ、ベン・スピース、カル・クラッチローといずれも転倒し、リタイアという残念な結果になった。
残り２戦、チャンピオンシップ争いはロレンソが有利ではあるが、連勝を続けるペドロサも初のチャンピオンシップ獲得に向けて全てをかけて望んでくることは間違いない。また、次戦オーストラリアＧＰはストーナーの母国グランプリであり、５年間連勝という絶対的な強さを誇る。守りきれるか、攻めきれるか、母国で錦を飾れるか、三者三様が織り成すオーストラリアＧＰはフィリップアイランドで１０月２８日に決勝レースが行われる。（編集担当：加藤隆文）
